Исследование состава микробиоты толстого кишечника

Колонофлор-16: исследование состояния микрофлоры толстого кишечника методом ПЦР – лабораторный метод диагностики, направленный на обнаружение полного спектра микроорганизмов, которые обитают в исследуемом отделе ЖКТ. Сюда относят нормальные, условно-патогенные и патогенные микроорганизмы, за счет которых происходит пищеварение, но также могут возникать патологии. Исследование проводят в кале, так как вместе с ним выделяются бактерии, которые содержатся в кишечнике. По показателям отслеживают нормальную или патологически измененную микрофлору, при которой могут формироваться воспалительные процессы, аллергические реакции, нарушение формирования стула и многие другие отклонения.

Цель исследования

Колонофлор-16 проводят для оценки следующей информации:

состав микрофлоры кишечника в профилактических целях, перед проведением консервативных тактик лечения, различных манипуляций, малоинвазивных или хирургических вмешательств;
причины нарушения формирования стула, в особенности, если другие тесты не предоставили полноценную информацию;
состояние микробиоты на фоне употребления различных лекарственных средств – гормоны, иммуносупрессанты, химиопрепараты;
причины отсутствия восстановления нормальной формы кала после различных кишечных инфекций, которые сопровождались диареей;
состав микрофлоры на фоне признаков дисбактериоза кишечника – тошнота, рвота, боль в животе, неприятный привкус во рту, отрыжка, нарушение формирования стула, изменение оттенка и консистенции каловых масс, появление посторонних примесей в фекалиях и другие;
причины отсутствия эффективности терапии системных аллергических реакций;
степень влияния иммунодефицита на состояние ЖКТ;
повреждающие факторы, которые приводят к снижению функции иммунитета и частым инфекционным заболеваниям;
причины частых грибковых и бактериальных инфекций полости рта.

Важно помнить, что состояние микробиоты кишечника влияет не только на ЖКТ, но и многие другие функции организма. Например, этот параметр тесно связан с состоянием иммунитета, развитием аллергических реакций. Поэтому важно своевременно стабилизировать микрофлору, чтобы не допустить системного влияния на организм с развитием сопутствующих осложнений.

Исследование проводят первично для постановки диагноза. Затем его можно повторять на протяжении терапии или после ее завершения, чтобы судить о результате.

Что такое колонофлор-16

Колонофлор-16 – это лабораторный диагностический тест, который отслеживает состояние микрофлоры толстого кишечника. Анализ проводят для пациентов от 14 лет и взрослых людей. Его выполняют при помощи ПЦР теста, чтобы в точности отслеживать генетический материал всех микроорганизмов, обитающих на поверхности слизистой оболочки толстого кишечника. Причем выявляют не только их разновидности, но и точное количество.

В микробиоту могут входить следующие виды микрофлоры:

нормальная – бифидобактерии, лактобактерии, непатогенная разновидность кишечной палочки;
условно-патогенная (все бактерии, которые в сниженных количествах не вызывают вреда, но при повышении приводят к воспалительному процессу) – патогенная разновидность кишечной палочки, клебсиелла, энтерококк, стафилококк и другие;
патогенная (вид бактерий, которые вызывают воспаление даже в минимальном количестве, в норме они не присутствуют в толстом кишечнике) – сальмонелла, шигелла и другие.

Даже если симптомы инфекционного процесса отсутствуют, анализ используют для других целей. Например, его применяют для выявления дисбактериоза, причин нарушения формирования стула. Во многих случаях на основании полученных результатов можно установить дифференциальный диагноз и сразу же приступить к методам терапии. Расшифровкой данных занимается врач-гастроэнтеролог, проктолог, терапевт.

Показания для анализа

Для проведения лабораторного теста методом ПЦР диагностики выделяют ряд показаний:

хроническая боль в животе с невыясненной причиной;
нарушение функции иммунитета разных видов – снижение активности иммунитета или иммунодефицит, аллергические реакции;
нарушение формирования стула в виде диареи и запора;
разные виды диспепсических расстройств – тошнота, рвота, повышенное газообразование в кишечнике, изжога, отрыжка, вздутый живот, неприятный привкус изо рта;
снижение аппетита, уменьшение массы тела, истощение;
воспалительные процессы пищеварительного тракта в разных участках, начиная от пищевода, заканчивая нижними отделами кишечника;
продолжительное лечение препаратами, которые могут повлиять на изменение состава микрофлоры;
терапия злокачественных новообразований при помощи химических средств или облучения.

Также исследование допустимо проводить профилактически. Например, для отслеживания состояния микрофлоры на фоне пубертатного возраста, климакса, старения организма у пожилых людей. Это связано с тем, что многие физиологические изменения или системные заболевания тоже могут влиять на состав микробиоты.

Как подготовиться к анализу

Перед сбором фекалий для проведения ПЦР исследования необходима предварительная подготовка со стороны пациента:

исключение употребления антибактериальных и антисептических средств в любой форме за 10-14 дней до сбора биоматериала;
исключение применения любых местных препаратов, вводимых в кишечник за 5-7 дней;
щадящий режим питания за 2-3 дня до исследования, то есть пациенту необходимо исключить жирную, острую, жареную, чрезмерно соленую, копченую еду, фастфуд;
исключение стресса, нервного напряжения за 3 дня, так как это может привести к выделению биологически активных веществ в кровь, что запустит повышенную моторику кишечника;
запрет проведения исследования в период инфекционно-воспалительных заболеваний системного типа (например, ОРВИ), а также спустя 5-7 дней после выздоровления;
запрет распития алкоголя за 2-3 дня.

Важно придерживаться всех назначений в точности, так как микробиота кишечника чувствительна к различным внешним и внутренним факторам.

Метод исследования

Образец фекалий размещают в стерильный контейнер Образец фекалий размещают в стерильный контейнер, плотно закручивая крышкой. Так биоматериал сохранится в первоначальном виде, на него не повлияют микроорганизмы и различные вещества. Его сразу же отправляют в лабораторию, где выполняют ПЦР диагностику по этапам.

Термическая обработка. Генетический материал бактерии содержит ДНК, скрученные в спирали. Они поддерживают такую форму за счет водородных связей. Их необходимо разрушить, сохранив при этом целостность генетической структуры. Поэтому температуру повышают только до 96°.
Понижение температуры. Ее опускают до 72°, чтобы перейти на следующий этап диагностики.
Применение реагента. Реагент на основе праймера вводят в образец. Он соединяется с нитями ДНК, поэтому дальнейшая реакция будет осуществляться в этой области.
Копирование генетического материала. Часто в образце фекалий содержится небольшое количество генетического материала микроорганизмов, что затрудняет диагностику. Поэтому выявленные нити ДНК копируют.
Применение ДНК-зонда. Генетический образец соединяют с ДНК-зондами, чтобы аппарат смог определить видовую принадлежность микроорганизмов.
Определение микроорганизмов. По содержанию ДНК-зонда анализатор выявляет разновидность бактерий и иных микроорганизмов, а также их точное количество.

В конце диагностики на аппарате распечатают бланк, где будет содержаться полноценная информация по составу микробиоты.

Расшифровка анализа

С лабораторным бланком обращаются к гастроэнтерологу, который проводит расшифровку. В результатах будет содержаться следующая информация:

сумма бактерий в образце;
разновидности нормальной микрофлоры и ее точное количество;
разновидности условно-патогенной микрофлоры и ее точное количество;
выявленная патогенная микрофлора, которая в норме должна отсутствовать, в случае ее обнаружения указывают точное количество.

Снизу бланка указывают отрицательный или положительный результат. Первый – свидетельствует о норме микрофлоры, отсутствии отклонений. При положительных данных обнаруживают дисбиоз. Для уточнения дифференциального диагноза указывают бактерии, которые вышли за пределы нормы.