РНК коронавирусов SARS-CoV-2 (ПЦР соскоб)

ПЦР диагностика соскоба на SARS-CoV-2

Коронавирус, возбудителем которого является SARS-CoV-2, представляет собой инфекционное заболевание, поражающее органы дыхания человека. Впервые человечество узнало о данной патологии в декабре 2019 года. Всего за несколько месяцев своего существования COVID-19 стал причиной пандемии, приобретшей мировой масштаб. Заболевание опасно наступлением летального исхода.

Исследование соскоба на обнаружение SARS-CoV-2 методом ПЦР проводится для выявления коронавируса, в том числе в случае его латентного течения, а также для дифференциальной диагностики инфекции, спровоцированной COVID-19 и иных респираторных заболеваний, протекающих со схожей клинической картиной. Выявление коронавирусной инфекции на раннем этапе ее развития, что возможно при проведении анализа методом ПЦР, позволяет своевременно провести требуемую терапию и тем самым снизить вероятность возникновения тяжелых последствий, обусловленных поражением организма SARS-CoV-2.

SARS-CoV-2 – общая информация

SARS-CoV-2 является РНК-содержащим вирусом, вызывающим коронавирусную инфекцию. Оболочка вируса состоит из структурных и неструктурных белков. К числу последних относятся протеаза и репликаза. Структурными белками, которые кодируют РНК SARS-CoV-2 являются: S-(spike) белок, Е-белок, N-белок, М-белок. Spike-белок также известен как белок-шип, поскольку на его поверхности присутствуют структуры, которые выступают подобно шипам, ввиду чего вирусным частицам приписывают определенное сходство с короной. Данной особенностью и объясняется название патологии – коронавирус.

Пик заболеваемости COVID 19 отмечается в осенне-зимнее время. Источником SARS-CoV-2 выступает человек, в том числе и при бессимптомном носительстве вируса. Инфицированный представляет для окружающих наибольшую опасность с последних двух дней инкубационного периода и на протяжении первых нескольких суток протекания заболевания. В среднем, инкубационный период длится в пределах 5-7 суток, максимальная же его продолжительность составляет две недели. COVID 19 имеет преимущественно воздушно-капельный путь передачи: частицы вируса SARS-CoV-2 передаются в процессе кашля, чихания, при общении на дистанции менее двух метров. Широкое распространение также получил контактный путь передачи коронавируса: при рукопожатиях и иных формах тесного взаимодействия с инфицированным человеком, посредством соприкосновения с контаминированным вирусом предметами. Имеются сведения о фекально-оральном механизме распространения вирусных частиц.

Ввиду того что в качестве «входных ворот» инфекции выступают дыхательные пути, SARS-CoV-2 провоцирует возникновение респираторных симптомов. У многих зараженных инфекционный процесс протекает в легкой форме. При этом присутствуют симптомы, характерные для ОРВИ. Так, у больного наблюдается слабость, повышенная утомляемость, общее недомогание, подъем температуры, кашель (может быть как сухим, так и сопровождаться отхождением мокроты).  Указанные симптомы COVID 19 получили свое наибольшее распространение. Другими, реже встречаемыми проявлениями коронавируса, являются внезапная потеря обоняния и вкуса, возникновение мышечной или суставной боли, заложенности носа, высыпаний на коже, тошноты, диареи, рвоты, развитие конъюнктивита.

В группу повышенного риска по развитию коронавирусной инфекции входят люди пожилого возраста, люди, страдающие хроническими заболеваниями, а также курильщики. У данной категории лиц COVID 19 может стать причиной развития тяжелой пневмонии. У детей обычно коронавирус протекает в легкой форме и не вызывает осложнений.

Согласно статистическим сведениям 80% заболевшим коронавирусной инфекцией достаточно консервативного лечения, 15% больных нуждаются в терапии в условиях стационара, а 5% инфицированных медицинская помощь оказывается в отделении интенсивной терапии.

Когда назначают анализ

Проведение ПЦР-диагностики на SARS-CoV-2 назначается квалифицированными пульмонологами, инфекционистами, педиатрами и терапевтами в следующих случаях:

• при наличии характерной для COVID 19 клинической симптоматики;
• при повышенной температуре тела неуточненной этиологии;
• при наличии симптомов ОРВИ;
• при необходимости дифференциальной диагностики коронавирусной инфекции и патологий, сопровождающихся схожими проявлениями;
• диагностика COVID 19 имеющей латентное течение;
• мониторинг эффективности проведенных терапевтических мероприятий;
• обследование лиц, находившихся в тесном контакте с больными COVID 19;
• обследование доноров крови;
• обследование лиц, составляющих группу риска;
• обследование на этапе планирования беременности;
• обследование беременных женщин;
• обследование лиц, находившихся в странах, где отмечается высокий уровень заболеваемости COVID 19, а также лиц, находившихся в контакте с указанными людьми.

Подготовка

Подготовка к предстоящему ПЦР-анализу на SARS-CoV-2 заключается в соблюдении обследуемым следующих рекомендаций, направленных на получение достоверного результата лабораторной диагностики:

• в течение двух суток до проведения исследования запрещается употреблять алкогольные напитки;
• за шесть часов до взятия соскоба клеток носоглотки и ротоглотки категорически запрещается проводить орошение ротовой полости лекарственными средствами, принимать рассасывающие таблетки, леденцы, использовать назальные спреи или капли;
• за три часа до получения биологического материала запрещается принимать пищу, пить воду и иные напитки, курить, проводить полоскание полости рта, чистку зубов, использовать любые средства, предназначенные для освежения дыхания;
• поскольку анализ не проводится анонимно, при посещении медицинского учреждения для прохождения тестирования с собой необходимо взять паспорт.

Метод исследования

Биологическим материалом, выступающим объектом лабораторной диагностики на SARS-CoV-2 выступает соскоб клеток ротоглотки и носоглотки. Его забор проводится в условиях медицинского учреждения. Процедуру выполняет квалифицированный медицинский работник. Перед проведением манипуляции обследуемый должен произвести троекратно полоскание полости рта кипяченой водой, имеющей комнатную температуру. В случае наличия в носу слизи перед получением биоматериала рекомендуется проводить высмаркивание. Мазок со слизистой оболочки носоглотки и ротоглотки берут разными зондами путем совершения вращательных движених в нижнем носовом ходе на глубине 5-6 см и с поверхности задней стенки ротоглотки, небных дужек и миндалин соответственно. После чего полученные два мазка совмещаются медицинским работником в одной пробирке. Исследование проводится ПЦР методом, который нацелен на распознавании в биологическом материале фрагментов РНК, принадлежащего SARS-CoV-2. Данный метод диагностики обладает высокой степенью специфичности и чувствительности. Он позволяет выявить возбудителя коронавирусной инфекции даже в случаях его ничтожно малой концентрации в исследуемом образце, поскольку основан на многократном копировании обнаруженных участков РНК, специфичных для  SARS-CoV-2. ПЦР-диагностика COVID 19 выполняется на современном специальном оборудовании. Весь процесс исследования автоматизирован, что способствует получению достоверного результата анализа в короткий срок.

Расшифровка анализа

Результаты ПЦР-анализа на SARS-CoV-2 выдаются в качественном формате и оформляются на специальном медицинском бланке. Положительный результат, при котором в исследуемом соскобе клеток носоглотки и ротоглотки были выявлены фрагменты искомого РНК указывает на наличие в организме обследуемого коронавирусной инфекции. Отрицательный результат свидетельствует об отсутствии COVID 19.  Он выдается тогда, когда в анализируемой пробе биоматериала не было найдено специфичных для SARS-CoV-2 фрагментов РНК или же в том случае, когда концентрация возбудителя коронавирусной инфекции оказалась ниже порога чувствительности тестовой системы.